Mischen Sie in einer großen Schüssel 250 g Spätzlemehl, 3 Eier, 150 ml Wasser, 1 TL Salz und eine Prise Muskatnuss zu einem zähen, glatten Teig. Lassen Sie den Teig für etwa 10 Minuten ruhen.

Bringen Sie in einem großen Topf 2 Liter Wasser mit 1 EL Salz zum Kochen. Verwenden Sie eine Spätzlepresse oder ein Sieb, um kleine Portionen des Teigs ins kochende Wasser zu drücken. Wenn die Spätzle an die Oberfläche steigen, sind sie nach circa 2–3 Minuten gar.

In einem mittelgroßen Topf 50 g Butter schmelzen, 200 ml Vollmilch dazu gießen und leicht erwärmen. Fügen Sie nach und nach 200 g Emmentaler und 100 g Gouda hinzu und rühren Sie ständig.

Schneiden Sie 2 große Zwiebeln in Ringe, tauchen Sie diese in Mehl und frittieren Sie sie in 250 ml Pflanzenöl bei 180 °C für 3–4 Minuten.

Vermengen Sie die abgetropften Spätzle mit der cremigen Käsesauce in einer großen Servierschüssel und garnieren Sie mit Röstzwiebeln und Schnittlauch.